49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3228 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3228  PAP2 family membrane protein  100 
 
 
190 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3277  PAP2 family protein  98.95 
 
 
190 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3265  PAP2 family membrane protein  98.95 
 
 
190 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1349  PAP2 family protein  85.26 
 
 
193 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6188  phosphoesterase, PA-phosphatase related  62.83 
 
 
195 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6736  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.5 
 
 
206 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7386  phosphoesterase, PA-phosphatase related  61.78 
 
 
195 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5919  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.66 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208723  normal  0.373663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4934  phosphoesterase PA-phosphatase related  52.91 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3803  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.87 
 
 
196 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.10058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3721  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.87 
 
 
196 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0369541  normal  0.206135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4560  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.87 
 
 
196 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3705  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.6 
 
 
198 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.27 
 
 
198 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2293  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.2 
 
 
196 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3727  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.23 
 
 
209 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0651813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2847  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.78 
 
 
233 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0594  PAP2 family protein  39.44 
 
 
232 aa  91.7  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0525  PAP2 family protein  43.36 
 
 
237 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4503  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.33 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3666  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.33 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.584382  normal  0.519121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3861  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.33 
 
 
232 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0697193  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0300  PAP2 family protein  38.8 
 
 
232 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2563  major facilitator superfamily permease  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2426  PAP2 family membrane protein  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.691634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0331  PAP2 family membrane protein  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1675  PAP2 family protein  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840167  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1479  PAP2 family membrane protein  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0866  PAP2 family protein  38.8 
 
 
232 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3758  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.33 
 
 
232 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.0238717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3229  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.33 
 
 
232 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.427666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2235  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38 
 
 
232 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  0.310017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4884  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.79 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4406  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.42 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265385  normal  0.277633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6803  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.687594  hitchhiker  0.000000852518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1188  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.6 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1575  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.32 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2503  PAP2 family membrane protein  43.07 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2203  PAP2 family protein  43.07 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2881  PAP2 family membrane protein  43.07 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.538288  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0033  PAP2 family protein  41.18 
 
 
244 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0648  PAP2 family membrane protein  41.01 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0633  PAP2 superfamily protein  41.01 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0811  PAP2 superfamily protein  41.01 
 
 
244 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0096  hypothetical protein  40.57 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134789  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5834  hypothetical protein  32 
 
 
226 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02338  hypothetical protein  34.76 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0193452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0729  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.46 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.35 
 
 
252 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>