53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5375 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5375  hemin transport protein HmuS; putative Hemin-degrading  100 
 
 		 346 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3538  Hemin-degrading family protein  46.22 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.913069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1604  hemin-degrading  45.99 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.837253  unclonable  0.000000365455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7221  Haemin-degrading family protein  45.06 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0183  hemin-degrading family protein  45.66 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3018  Haemin-degrading family protein  43.77 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0282112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3269  Hemin-degrading family protein  43.54 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902225  hitchhiker  0.00938257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62330  putative hemin degrading factor  46.34 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.648061  normal  0.832847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5425  putative hemin degrading factor  44.71 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2168  hemin-degrading family protein  41.45 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41951  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2338  hemin-degrading family protein  43.24 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3337  hemin-degrading family protein  44.22 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384676  hitchhiker  0.00153291 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0825  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1116  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03723  hemin transport protein  45 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000267983  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0439  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1780  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2090  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1827  hemin transport protein HmuS  45.81 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2140  hemin transport protein HmuS  46.04 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0346  hemin transport protein HmuS  45.51 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0649  hemin transport protein  39.18 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.626507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3890  hemin-degrading family protein  39.18 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5316  hemin-degrading family protein  43.98 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1740  hemin-degrading family protein  40.72 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00804322  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0220  heme degradation protein  44.11 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3802  hemin transport protein HmuS  38.89 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157449  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3621  hemin-degrading family protein  41.45 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4773  hemin-degrading family protein  43.07 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0444544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0854  hemin-degrading family protein  40.94 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4837  hemin-degrading family protein  44.01 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5432  hemin-degrading family protein  43.41 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0323497  normal  0.82601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5430  hemin-degrading  43.41 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2459  Hemin-degrading family protein  39.3 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  41.39 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3081  hemin-degrading family protein  39.66 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0519354  normal  0.34634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2761  hemin-degrading family protein  37.65 
 
 		 349 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4856  hemin transport protein HmuS  37.72 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2835  Hemin-degrading family protein  40.18 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3801  hemin transport protein HmuS  37.43 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.189206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0458  hemin transport protein HmuS  38.91 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.269678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5068  hemin-degrading family protein  41.52 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0346  hemin-degrading  38.41 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1209  Hemin-degrading family protein  42.14 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2133  hemin-degrading  37.65 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.632586  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0574  hemin transport protein hmuS  37.09 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4202  hemin-degrading family protein  37.65 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1507  hemin-degrading family protein  34.51 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.823077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2932  hemin transport protein HmuS  36.09 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.30987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1398  hemin-degrading family protein  32.88 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1871  putative hemin transport protein  31.08 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.355222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0228  putative hemin transport protein  30.74 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0665  heme transport/degradation factor  56.67 
 
 		 60 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136001  normal  0.671418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>