53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_62330  putative hemin degrading factor  100 
 
 
354 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.648061  normal  0.832847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5425  putative hemin degrading factor  92.66 
 
 
354 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1604  hemin-degrading  45.03 
 
 
347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.837253  unclonable  0.000000365455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7221  Haemin-degrading family protein  45.61 
 
 
344 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0346  hemin transport protein HmuS  48.1 
 
 
383 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03723  hemin transport protein  49.41 
 
 
380 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000267983  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1780  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
402 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2090  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
383 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0439  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
383 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1116  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
383 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0825  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
383 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1827  hemin transport protein HmuS  47.81 
 
 
382 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2140  hemin transport protein HmuS  47.77 
 
 
402 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0183  hemin-degrading family protein  48.8 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0870539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5068  hemin-degrading family protein  46.53 
 
 
374 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4773  hemin-degrading family protein  45.38 
 
 
363 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0444544  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3081  hemin-degrading family protein  45.43 
 
 
366 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0519354  normal  0.34634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3538  Hemin-degrading family protein  45.71 
 
 
348 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.913069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0220  heme degradation protein  47.32 
 
 
363 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4837  hemin-degrading family protein  47.02 
 
 
363 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378411  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5430  hemin-degrading  47.01 
 
 
363 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5432  hemin-degrading family protein  47.01 
 
 
363 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0323497  normal  0.82601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3337  hemin-degrading family protein  46.38 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384676  hitchhiker  0.00153291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0854  hemin-degrading family protein  43.6 
 
 
365 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5316  hemin-degrading family protein  44.85 
 
 
363 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80021  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5375  hemin transport protein HmuS; putative Hemin-degrading  46.34 
 
 
346 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2338  hemin-degrading family protein  44.94 
 
 
355 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0649  hemin transport protein  43.2 
 
 
345 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.626507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3890  hemin-degrading family protein  43.2 
 
 
345 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3621  hemin-degrading family protein  43.54 
 
 
358 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3802  hemin transport protein HmuS  42.9 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1740  hemin-degrading family protein  43.67 
 
 
342 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00804322  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3269  Hemin-degrading family protein  40.94 
 
 
349 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902225  hitchhiker  0.00938257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2459  Hemin-degrading family protein  41.69 
 
 
350 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2168  hemin-degrading family protein  43.58 
 
 
344 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41951  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  42.81 
 
 
346 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3018  Haemin-degrading family protein  40.99 
 
 
349 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0282112  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3801  hemin transport protein HmuS  41.44 
 
 
342 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.189206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2761  hemin-degrading family protein  41.11 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2835  Hemin-degrading family protein  42.9 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4856  hemin transport protein HmuS  40.84 
 
 
342 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0458  hemin transport protein HmuS  37.35 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.269678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0574  hemin transport protein hmuS  42.11 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4202  hemin-degrading family protein  41.33 
 
 
346 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358163  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0346  hemin-degrading  38.7 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1209  Hemin-degrading family protein  40.76 
 
 
343 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2133  hemin-degrading  40.72 
 
 
351 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.632586  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2932  hemin transport protein HmuS  37.85 
 
 
347 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.30987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1507  hemin-degrading family protein  34.9 
 
 
394 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.823077  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1398  hemin-degrading family protein  34.46 
 
 
328 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1871  putative hemin transport protein  34.8 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.355222  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0228  putative hemin transport protein  34.24 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0665  heme transport/degradation factor  51.67 
 
 
60 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136001  normal  0.671418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>