53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1604 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1604  hemin-degrading  100 
 
 
347 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.837253  unclonable  0.000000365455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3337  hemin-degrading family protein  54.49 
 
 
376 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384676  hitchhiker  0.00153291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0220  heme degradation protein  54.49 
 
 
363 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4837  hemin-degrading family protein  54.19 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378411  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5430  hemin-degrading  54.22 
 
 
363 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5432  hemin-degrading family protein  54.22 
 
 
363 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0323497  normal  0.82601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4773  hemin-degrading family protein  54.03 
 
 
363 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0444544  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5316  hemin-degrading family protein  53.73 
 
 
363 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80021  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1780  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
402 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2090  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
383 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0439  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
383 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1116  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
383 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.95887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0825  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
383 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1827  hemin transport protein HmuS  51.34 
 
 
382 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0346  hemin transport protein HmuS  51.04 
 
 
383 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2140  hemin transport protein HmuS  50.15 
 
 
402 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3081  hemin-degrading family protein  50.14 
 
 
366 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0519354  normal  0.34634 
 
 
-
 
NC_003296  RS03723  hemin transport protein  50.61 
 
 
380 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000267983  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0183  hemin-degrading family protein  54.57 
 
 
350 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0870539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5068  hemin-degrading family protein  48.08 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3538  Hemin-degrading family protein  48.92 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.913069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7221  Haemin-degrading family protein  46.4 
 
 
344 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5425  putative hemin degrading factor  45.48 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62330  putative hemin degrading factor  45.03 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.648061  normal  0.832847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3621  hemin-degrading family protein  45.29 
 
 
358 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5375  hemin transport protein HmuS; putative Hemin-degrading  45.99 
 
 
346 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3269  Hemin-degrading family protein  42.41 
 
 
349 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902225  hitchhiker  0.00938257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3018  Haemin-degrading family protein  42.11 
 
 
349 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0282112  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2338  hemin-degrading family protein  44.21 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0458  hemin transport protein HmuS  41.95 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.269678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2459  Hemin-degrading family protein  39.94 
 
 
350 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0854  hemin-degrading family protein  39.45 
 
 
365 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0346  hemin-degrading  41.57 
 
 
359 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  38.17 
 
 
346 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3890  hemin-degrading family protein  38.94 
 
 
345 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0649  hemin transport protein  38.94 
 
 
345 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.626507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2761  hemin-degrading family protein  38.64 
 
 
349 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2835  Hemin-degrading family protein  40.31 
 
 
343 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3802  hemin transport protein HmuS  38.64 
 
 
345 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157449  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4202  hemin-degrading family protein  39.69 
 
 
346 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358163  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2168  hemin-degrading family protein  38.32 
 
 
344 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41951  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4856  hemin transport protein HmuS  37.5 
 
 
342 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2133  hemin-degrading  39.87 
 
 
351 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.632586  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3801  hemin transport protein HmuS  37.38 
 
 
342 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.189206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1740  hemin-degrading family protein  37.96 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00804322  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1209  Hemin-degrading family protein  39.08 
 
 
343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0574  hemin transport protein hmuS  37.69 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2932  hemin transport protein HmuS  35.14 
 
 
347 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.30987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1507  hemin-degrading family protein  34.21 
 
 
394 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.823077  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1398  hemin-degrading family protein  31.11 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0228  putative hemin transport protein  31.35 
 
 
317 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1871  putative hemin transport protein  30.19 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.355222  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0665  heme transport/degradation factor  60 
 
 
60 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136001  normal  0.671418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>