18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3754 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5752  hypothetical protein  93.33 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2699  hypothetical protein  68.57 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5744  hypothetical protein  65 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4266  hypothetical protein  59.14 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4413  hypothetical protein  61 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5760  hypothetical protein  59 
 
 		 105 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0595189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5100  hypothetical protein  59 
 
 		 105 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6104  hypothetical protein  56.31 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.25478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0504  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0602  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0617  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0790  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6399  hypothetical protein  53.4 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1114  hypothetical protein  50.98 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7367  hypothetical protein  52.34 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1026  hypothetical protein  52.34 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1022  hypothetical protein  53.33 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>