18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1026 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1026  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4413  hypothetical protein  74.77 
 
 
105 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1022  hypothetical protein  95.5 
 
 
109 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5100  hypothetical protein  76.58 
 
 
105 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5760  hypothetical protein  76.58 
 
 
105 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0595189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7367  hypothetical protein  84.68 
 
 
111 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4266  hypothetical protein  67.89 
 
 
103 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3835  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0790  hypothetical protein  63.96 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0504  hypothetical protein  63.96 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0617  hypothetical protein  63.96 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0602  hypothetical protein  63.96 
 
 
105 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6104  hypothetical protein  54.13 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.25478  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6399  hypothetical protein  51.38 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2699  hypothetical protein  58.88 
 
 
105 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1114  hypothetical protein  51.38 
 
 
103 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5752  hypothetical protein  57.41 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3754  hypothetical protein  55.14 
 
 
105 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5744  hypothetical protein  56.76 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>