18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6399 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6399  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6104  hypothetical protein  96.12 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.25478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1114  hypothetical protein  78.64 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4266  hypothetical protein  64.08 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5100  hypothetical protein  57.28 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5760  hypothetical protein  57.28 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0595189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4413  hypothetical protein  56.31 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7367  hypothetical protein  52.29 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1022  hypothetical protein  53.27 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0617  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0602  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0504  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0790  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1026  hypothetical protein  51.38 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3754  hypothetical protein  52.43 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2699  hypothetical protein  48.04 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5752  hypothetical protein  49.5 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5744  hypothetical protein  45 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>