18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5752 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5752  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3754  hypothetical protein  93.33 
 
 
105 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2699  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5744  hypothetical protein  63.81 
 
 
105 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4266  hypothetical protein  60.64 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4413  hypothetical protein  61.39 
 
 
105 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5100  hypothetical protein  61.39 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5760  hypothetical protein  61.39 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0595189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0790  hypothetical protein  50.98 
 
 
105 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0504  hypothetical protein  50.98 
 
 
105 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0617  hypothetical protein  50.98 
 
 
105 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0602  hypothetical protein  50.98 
 
 
105 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6104  hypothetical protein  51.49 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.25478  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6399  hypothetical protein  49.5 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1114  hypothetical protein  49.5 
 
 
103 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7367  hypothetical protein  52.78 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1022  hypothetical protein  52.83 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1026  hypothetical protein  53.7 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>