18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6104 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6104  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.25478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6399  hypothetical protein  96.12 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1114  hypothetical protein  80.58 
 
 		 103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4266  hypothetical protein  65.05 
 
 		 103 aa  133  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.3835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5760  hypothetical protein  58.25 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0595189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5100  hypothetical protein  58.25 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4413  hypothetical protein  57.28 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1022  hypothetical protein  56.07 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0617  hypothetical protein  51.46 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0602  hypothetical protein  51.46 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0504  hypothetical protein  51.46 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.773953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0790  hypothetical protein  51.46 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7367  hypothetical protein  54.13 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1026  hypothetical protein  54.13 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3754  hypothetical protein  55.34 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2699  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.227712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5752  hypothetical protein  51.49 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5744  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>