57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0013 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  87.85 
 
 		 110 aa  196  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  55.77 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  52.38 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  54.37 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  49.15 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  50 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  51.43 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  51.43 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  48.04 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  52.69 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.23 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.4 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  48 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  44.12 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  44.66 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  47.06 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  48 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  44.34 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  46.46 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  42.72 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  42.99 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  43.16 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  48.39 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  46 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.46 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  40.38 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  40.22 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  41.9 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  41.12 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  45 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  40.22 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  40.22 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  39 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  43 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  44 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  33.98 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.68 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  43.27 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  37.36 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  33.65 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  40.35 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1339  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>