58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0014 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  49.58 
 
 
120 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  50.49 
 
 
104 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  52.43 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  51.46 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  52.34 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  50.44 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  46.6 
 
 
129 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.13 
 
 
127 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  49.5 
 
 
142 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  46.43 
 
 
125 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.64 
 
 
116 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  47.66 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  47.17 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  43.52 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  44.23 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  42.57 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.02 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  45.54 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  40.52 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  44.76 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.96 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  41.35 
 
 
122 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  39.82 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  33.64 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  42.59 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.51 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  40.59 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  35.51 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  35.51 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  43.62 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  42.11 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.42 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  39.45 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  33.33 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  37.5 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  34 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  41.05 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
265 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  40.43 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  38.95 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  38.95 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  41.05 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  36.17 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  32.08 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  35 
 
 
98 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1674  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  27.59 
 
 
252 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125472  hitchhiker  0.00246958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1054  pyrophosphatase  32.39 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>