57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0579 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  98 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  95.05 
 
 		 101 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  80.81 
 
 		 101 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  78.79 
 
 		 101 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  74.26 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  86.14 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  85 
 
 		 100 aa  153  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  85.15 
 
 		 101 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  83.17 
 
 		 101 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46 
 
 		 120 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  51.09 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  45.1 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  45 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  42.57 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.39 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  46.39 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  47.42 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  45.36 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  40.82 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  40.78 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.16 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  43.88 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.14 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.32 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  43.62 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.05 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  39.6 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  39 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  39 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  43.33 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  37 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.32 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  36.73 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  35.8 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.67 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  29.41 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  39 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  38.67 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  33.98 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  32 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 265 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  39.58 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0099  hypothetical protein  36.21 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>