16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1640 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1640  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 		 236 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1867  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.91 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3300  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.29 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5078  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.44 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0570  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.73 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1291  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.5 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.599951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0308  hypothetical protein  36.53 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00170845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0443  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.2 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 		 1027 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6017  CRISPR-associated protein Cas5  33.78 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1002  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.18 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1389  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.99 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2300  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.17 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.88 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0900  CRISPR-associated protein Cas5  25.97 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1085  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.29 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>