16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1389 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1389  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 		 263 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  65.64 
 
 		 1027 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1002  CRISPR-associated Cas5 family protein  58.62 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1291  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.73 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.599951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0443  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.55 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0570  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.09 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1867  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.77 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0308  hypothetical protein  31.91 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00170845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2300  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.05 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1640  CRISPR-associated protein Cas5  30.94 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3300  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.94 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5078  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.22 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0124  CRISPR-associated protein Cas5 family  25.85 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2006  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.41 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2311  CRISPR-associated protein DevS  30.26 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000474107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6017  CRISPR-associated protein Cas5  26.71 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.888817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>