56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4672 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4672  ferric iron reductase  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5734  iron reductase  50.57 
 
 
261 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2193  ferric iron reductase  33.91 
 
 
251 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544293  decreased coverage  0.00470622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4136  ferric iron reductase  34.48 
 
 
251 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2861  ferric iron reductase  33.62 
 
 
247 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0523234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2784  ferric iron reductase  32.67 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3257  ferric iron reductase  29.87 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1674  ferric iron reductase protein FhuF  31.13 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3714  ferric iron reductase  29.1 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.73851  normal  0.0269433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1675  ferric iron reductase protein  32.18 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  30.2 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3191  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  28.1 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182603  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2548  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.05 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2449  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.05 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994573  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4871  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  26.27 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4803  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  27.16 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  0.863777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4906  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  27.16 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4958  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  26.63 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2635  ferric iron reductase  27.4 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4964  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  25.64 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0710242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4783  ferric iron reductase  30.32 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200161  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1534  ferric iron reductase  27.54 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.75472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1555  ferric iron reductase  27.54 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494875  normal  0.652655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0522  putative iron reductase  26.82 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1637  ferric iron reductase  27.36 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.081443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1157  ferric iron reductase  27.36 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4068  putative iron reductase  26.82 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42261  normal  0.237664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1601  ferric iron reductase  26.83 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1612  ferric iron reductase  27.36 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113316  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3737  ferric iron reductase  29.69 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3725  ferric iron reductase protein FhuF  28.7 
 
 
276 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.237876 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4600  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.59 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000151516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3630  ferric iron reductase  24.1 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0343034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04210  hypothetical protein  24.1 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4961  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.59 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0527  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  25.13 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1936  ferric iron reductase protein  27.27 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0320531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1922  ferric iron reductase protein FhuF  27.27 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04244  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  24.1 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2082  ferric iron reductase protein FhuF  27.27 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4913  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.59 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000171734  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4909  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.3 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3688  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.3 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.141102  hitchhiker  0.000160651 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0869  ferric iron reductase protein FhuF  26.74 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0292  ferric iron reductase protein FhuF  26.74 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00908617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1629  ferric iron reductase protein FhuF  26.74 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1186  ferric iron reductase protein FhuF  26.74 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0169384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5880  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.3 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.061734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5551  hypothetical protein  36.45 
 
 
341 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3495  ferric iron reductase  27.32 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.495809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2422  ferric iron reductase protein FhuF  26.78 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.122755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1506  ferric iron reductase  24.76 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1305  ferric iron reductase  31.53 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2298  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1516  ferric iron reductase  25.23 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00751668  normal  0.821381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1450  ferric iron reductase  25.23 
 
 
345 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.756518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>