44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5551 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5551  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3495  ferric iron reductase  52 
 
 
251 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.495809  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2298  hypothetical protein  40.71 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5061  hypothetical protein  43.69 
 
 
232 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3544  hypothetical protein  40.59 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2666  ferric iron reductase  42.23 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2213  ferric iron reductase  40.59 
 
 
225 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2090  ferric iron reductase  43.5 
 
 
239 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1818  ferric iron reductase  36.69 
 
 
245 aa  92.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.350826  normal  0.0175949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5840  hypothetical protein  30.62 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812828  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2012  ferric iron reductase  31.02 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0301477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2268  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12751  cysteine rich protein  50.85 
 
 
57 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208839  normal  0.0427542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  45.07 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3725  ferric iron reductase protein FhuF  29.71 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.237876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0527  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.65 
 
 
262 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01767  hypothetical protein  29.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1675  ferric iron reductase protein  34.24 
 
 
183 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1740  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4600  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  30.48 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4906  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.57 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4803  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  30.43 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  0.863777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1983  ferric iron reductase  26.57 
 
 
248 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000850191  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4672  ferric iron reductase  36.45 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4871  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  33 
 
 
262 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987545  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4958  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  32 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659446  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4913  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.52 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000171734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3737  ferric iron reductase  28.93 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0417  hypothetical protein  28.88 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4909  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  28.85 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000454777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4964  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  32 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0710242  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5734  iron reductase  26.09 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  30.05 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5880  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.52 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.061734  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4961  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.52 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04210  hypothetical protein  29.52 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04244  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.52 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3688  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  29.52 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.141102  hitchhiker  0.000160651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2191  hypothetical protein  26.92 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3630  ferric iron reductase  29.52 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0343034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2813  ferric iron reductase  22.79 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00899637  normal  0.638181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2734  ferric iron reductase  41.46 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000124929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2712  ferric iron reductase  41.46 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.810996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>