51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2193 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2193  ferric iron reductase  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544293  decreased coverage  0.00470622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4136  ferric iron reductase  48.54 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4672  ferric iron reductase  33.91 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5734  iron reductase  30 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2861  ferric iron reductase  29.41 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0523234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2784  ferric iron reductase  33.48 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3257  ferric iron reductase  27.8 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3714  ferric iron reductase  25.65 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.73851  normal  0.0269433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1674  ferric iron reductase protein FhuF  26.29 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  30.18 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2635  ferric iron reductase  27.27 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3737  ferric iron reductase  29.02 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3191  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.95 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182603  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2548  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.95 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2449  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.95 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1534  ferric iron reductase  34.07 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.75472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0522  putative iron reductase  30.35 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4783  ferric iron reductase  34.07 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200161  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1637  ferric iron reductase  32.98 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.081443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1157  ferric iron reductase  32.98 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4913  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.79 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000171734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1675  ferric iron reductase protein  31.32 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1555  ferric iron reductase  32.97 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494875  normal  0.652655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1612  ferric iron reductase  32.46 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113316  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3688  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.33 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.141102  hitchhiker  0.000160651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4909  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.33 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1305  ferric iron reductase  35.2 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04244  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.54 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04210  hypothetical protein  22.54 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3630  ferric iron reductase  22.54 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0343034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4600  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  22.58 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000151516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4961  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  21.86 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5880  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  21.86 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.061734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0527  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  25.13 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4958  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  24.38 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1936  ferric iron reductase protein  30.65 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0320531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1922  ferric iron reductase protein FhuF  30.65 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2082  ferric iron reductase protein FhuF  30.65 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1601  ferric iron reductase  29.28 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4068  putative iron reductase  30.39 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42261  normal  0.237664 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0292  ferric iron reductase protein FhuF  30.11 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00908617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1629  ferric iron reductase protein FhuF  30.11 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4871  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  24.38 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0869  ferric iron reductase protein FhuF  30.11 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1186  ferric iron reductase protein FhuF  30.11 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0169384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4906  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.88 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4964  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.88 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0710242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3725  ferric iron reductase protein FhuF  26.63 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4803  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  23.56 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  0.863777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2422  ferric iron reductase protein FhuF  29.83 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.122755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3495  ferric iron reductase  27.62 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.495809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>