56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2548 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2548  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3191  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  99.61 
 
 		 259 aa  537  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182603  hitchhiker  0.00976656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2449  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.994573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4913  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  35.77 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000171734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3688  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  35.37 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.141102  hitchhiker  0.000160651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4909  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  35.37 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000454777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4600  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.96 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000151516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4961  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.55 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3630  ferric iron reductase  38.68 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0343034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04210  hypothetical protein  38.68 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04244  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  38.68 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0540348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5880  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  38.21 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.061734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4906  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.84 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4803  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.84 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  0.863777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0527  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.94 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  hitchhiker  0.00618312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4958  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.43 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4964  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.43 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0710242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4871  ferric iron reductase involved in ferric hydroximate transport  34.02 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00987545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1450  ferric iron reductase  32.35 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.756518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1506  ferric iron reductase  33 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1516  ferric iron reductase  31.37 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00751668  normal  0.821381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2861  ferric iron reductase  26.72 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0523234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3034  ferric iron reductase protein, putative  28.05 
 
 		 361 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2415  ferric iron reductase  24.85 
 
 		 374 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2813  ferric iron reductase  27.38 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00899637  normal  0.638181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1652  ferric iron reductase  27.53 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000058047  hitchhiker  0.0000000000759871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2734  ferric iron reductase  25.3 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000124929  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2635  ferric iron reductase  24.29 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5734  iron reductase  24.05 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2712  ferric iron reductase  28.17 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.810996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3714  ferric iron reductase  25.71 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.73851  normal  0.0269433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  27.64 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4672  ferric iron reductase  29.05 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2193  ferric iron reductase  22.95 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544293  decreased coverage  0.00470622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1612  ferric iron reductase  25.1 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113316  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1601  ferric iron reductase  26.32 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1674  ferric iron reductase protein FhuF  27.23 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1157  ferric iron reductase  26.83 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1637  ferric iron reductase  26.83 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.081443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4783  ferric iron reductase  26.9 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200161  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1534  ferric iron reductase  26.26 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.75472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1555  ferric iron reductase  26.15 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494875  normal  0.652655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0522  putative iron reductase  27.72 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3257  ferric iron reductase  24.28 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4136  ferric iron reductase  23.24 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1936  ferric iron reductase protein  26.04 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0320531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1922  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2082  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4068  putative iron reductase  26.77 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42261  normal  0.237664 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0292  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00908617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1629  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1186  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0169384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0869  ferric iron reductase protein FhuF  26.04 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1675  ferric iron reductase protein  24.44 
 
 		 183 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2784  ferric iron reductase  21.28 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2422  ferric iron reductase protein FhuF  25.65 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.122755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>