14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1042 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5325  hypothetical protein  45.98 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5301  hypothetical protein  42.35 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1557  hypothetical protein  49.18 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0948  hypothetical protein  39.76 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1464  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3839  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00356032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1279  hypothetical protein  38.03 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4259  hypothetical protein  32.94 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116623  normal  0.995329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7667  hypothetical protein  35.63 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6196  hypothetical protein  30.95 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1956  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0987505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0607  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1158  hypothetical protein  33.73 
 
 		 86 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>