12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0948 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3839  hypothetical protein  62.79 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00356032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1464  hypothetical protein  63.22 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7667  hypothetical protein  60.67 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1279  hypothetical protein  57.47 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1158  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3101  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1557  hypothetical protein  55 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5301  hypothetical protein  38.16 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560349 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5325  hypothetical protein  39.08 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1042  hypothetical protein  39.76 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6255  hypothetical protein  38.18 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>