11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5325 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5325  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  240  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1042  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5301  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0948  hypothetical protein  39.08 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7667  hypothetical protein  37.65 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1279  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1557  hypothetical protein  49.09 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1464  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3839  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00356032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1158  hypothetical protein  38.55 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3101  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>