13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1279 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3839  hypothetical protein  82.02 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00356032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1464  hypothetical protein  72.41 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.891607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0948  hypothetical protein  57.47 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7667  hypothetical protein  48.28 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1158  hypothetical protein  43.02 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550349  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5301  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3101  hypothetical protein  40.7 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1557  hypothetical protein  46.55 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1042  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6255  hypothetical protein  32.63 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6196  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>