50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_R0031 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4583  tRNA-Lys  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0571835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  97.87 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0021  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356403  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0016  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0033  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0031  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  93.94 
 
 		 367 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  93.94 
 
 		 378 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0604  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.398612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0014  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0051  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>