20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0250 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3214  cytochrome c family protein  33.63 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3748  hypothetical protein  30.07 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1883  hypothetical protein  30.07 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00949083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3909  hypothetical protein  33 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3152  cytochrome c family protein  31.13 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2990  cytochrome c family protein, putative  29.59 
 
 		 153 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.7010100000000002e-18  normal  0.382415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0533  cytochrome c family protein, putative  27.43 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00012786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.22 
 
 		 426 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.83 
 
 		 650 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1866  hypothetical protein  30.17 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.20083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.02 
 
 		 650 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 656 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1031  hypothetical protein  36.17 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  0.809663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  23.74 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 658 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  26.42 
 
 		 553 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  23.53 
 
 		 930 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 576 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  24.09 
 
 		 490 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>