24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0221 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1221  benzoyl-CoA oxygenase subunit B  79.92 
 
 		 474 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868676  normal  0.0136079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2695  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  80 
 
 		 475 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1539  benzoyl-CoA oxygenase component B (BoxB)  79.79 
 
 		 475 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3660  benzoyl-CoA dioxygenase B  90.11 
 
 		 475 aa  904    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0073  benzoyl-CoA oxygenase component B  81.05 
 
 		 475 aa  822    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6639  benzoyl-CoA oxygenase, component B  64.21 
 
 		 482 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480695  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0733  benzoyl-CoA oxygenase component B  75.95 
 
 		 475 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2943  benzoyl-CoA oxygenase component B  84.42 
 
 		 475 aa  856    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3908  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  68.99 
 
 		 475 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0891  benzoyl-CoA oxygenase, component B  80 
 
 		 475 aa  816    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.205884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1423  benzoyl-CoA oxygenase, component B  79.79 
 
 		 475 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1629  benzoyl-CoA oxygenase, component B  84.84 
 
 		 475 aa  859    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0228  hypothetical protein  66.11 
 
 		 500 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.11346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0221  benzoyl-CoA oxygenase component B  100 
 
 		 475 aa  991    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0094  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  79.75 
 
 		 475 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.606518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1324  benzoyl-CoA oxygenase, component B  79.7 
 
 		 474 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0750  benzoyl-CoA oxygenase, component B  61.68 
 
 		 478 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4653  benzoyl-CoA oxygenase component  61.64 
 
 		 481 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0881  putative benzoyl-CoA oxygenase component  61.01 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0792752  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0744  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  61.81 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0672  benzoyl-CoA oxygenase, component B  59.79 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5225  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  63.03 
 
 		 470 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2007  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  59.66 
 
 		 477 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0733608  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0807  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  25.27 
 
 		 311 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>