23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3660 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4653  benzoyl-CoA oxygenase component  63.1 
 
 		 481 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0094  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  82.07 
 
 		 475 aa  829    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.606518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3908  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  69.2 
 
 		 475 aa  701    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0744  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  63.31 
 
 		 483 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2695  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  80.63 
 
 		 475 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1539  benzoyl-CoA oxygenase component B (BoxB)  79.79 
 
 		 475 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3660  benzoyl-CoA dioxygenase B  100 
 
 		 475 aa  989    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0073  benzoyl-CoA oxygenase component B  82.74 
 
 		 475 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6639  benzoyl-CoA oxygenase, component B  65.05 
 
 		 482 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480695  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0750  benzoyl-CoA oxygenase, component B  63.58 
 
 		 478 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0733  benzoyl-CoA oxygenase component B  78.06 
 
 		 475 aa  794    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2943  benzoyl-CoA oxygenase component B  85.26 
 
 		 475 aa  863    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1221  benzoyl-CoA oxygenase subunit B  80.13 
 
 		 474 aa  813    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868676  normal  0.0136079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0881  putative benzoyl-CoA oxygenase component  63.1 
 
 		 496 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0792752  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0891  benzoyl-CoA oxygenase, component B  81.05 
 
 		 475 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.205884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1423  benzoyl-CoA oxygenase, component B  80.84 
 
 		 475 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1629  benzoyl-CoA oxygenase, component B  86.11 
 
 		 475 aa  866    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0228  hypothetical protein  66.03 
 
 		 500 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.11346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0221  benzoyl-CoA oxygenase component B  90.11 
 
 		 475 aa  904    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1324  benzoyl-CoA oxygenase, component B  79.92 
 
 		 474 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0672  benzoyl-CoA oxygenase, component B  60.08 
 
 		 482 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5225  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  63.68 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2007  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  61.15 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0733608  normal  0.849708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>