26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0881 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4653  benzoyl-CoA oxygenase component  95.63 
 
 		 481 aa  968    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0744  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  90.02 
 
 		 483 aa  918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3660  benzoyl-CoA dioxygenase B  63.1 
 
 		 475 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6639  benzoyl-CoA oxygenase, component B  78.71 
 
 		 482 aa  817    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480695  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0750  benzoyl-CoA oxygenase, component B  90.79 
 
 		 478 aa  922    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1221  benzoyl-CoA oxygenase subunit B  63.66 
 
 		 474 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868676  normal  0.0136079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0881  putative benzoyl-CoA oxygenase component  100 
 
 		 496 aa  1035    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0792752  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1324  benzoyl-CoA oxygenase, component B  63.45 
 
 		 474 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0228  hypothetical protein  68.21 
 
 		 500 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.11346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0672  benzoyl-CoA oxygenase, component B  74.95 
 
 		 482 aa  757    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1539  benzoyl-CoA oxygenase component B (BoxB)  62.24 
 
 		 475 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1629  benzoyl-CoA oxygenase, component B  61.22 
 
 		 475 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2695  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  60.59 
 
 		 475 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1423  benzoyl-CoA oxygenase, component B  60.17 
 
 		 475 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0891  benzoyl-CoA oxygenase, component B  60.38 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.205884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0221  benzoyl-CoA oxygenase component B  61.01 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3908  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  61.34 
 
 		 475 aa  618  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0073  benzoyl-CoA oxygenase component B  60.13 
 
 		 475 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5225  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  63.19 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2943  benzoyl-CoA oxygenase component B  60.17 
 
 		 475 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0094  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  60.13 
 
 		 475 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.606518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0733  benzoyl-CoA oxygenase component B  58.28 
 
 		 475 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2007  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  59.28 
 
 		 477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0733608  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2888  phenylacetic acid catabolic family protein  20.85 
 
 		 313 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2833  phenylacetic acid catabolic family protein  25.79 
 
 		 311 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1027  phenylacetic acid catabolic family protein  23.26 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.144453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>