76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0143 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0143  phosphonate metabolism  100 
 
 		 394 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0020256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5942  phosphonate metabolism  68.94 
 
 		 381 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2181  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  66.17 
 
 		 390 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0396272  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3775  phosphonate metabolism protein  68.15 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2959  phosphonate metabolism  68.31 
 
 		 368 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6096  phosphonate metabolism  68.52 
 
 		 364 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3855  phosphonate metabolism  64.97 
 
 		 368 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3343  phosphonate metabolism protein PhnI  68.18 
 
 		 402 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3354  phosphonate metabolism protein (PhnI)  68.18 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2588  phosphonate metabolism protein PhnI  67.64 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.977228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3309  phosphonate metabolism protein PhnI  67.91 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1179  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  67.64 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0318  phosphonate metabolism protein PhnI  67.64 
 
 		 405 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2402  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  67.64 
 
 		 405 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2922  phosphonate metabolism  65.44 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.412062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2561  phosphonate metabolism protein PhnI  64.57 
 
 		 359 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1751  hypothetical protein  65.05 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20380  hypothetical protein  64.54 
 
 		 366 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140079  normal  0.853363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2884  phosphonate metabolism  65.86 
 
 		 358 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2912  phosphonate metabolism  63.44 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2253  phosphonate metabolism  63.52 
 
 		 359 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0815  phosphonate metabolism  61.78 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3827  phosphonate metabolism  61.87 
 
 		 368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4091  phosphonate metabolism  62.73 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658015  normal  0.0458753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5846  putative PhnI protein, phosphonate metabolism  62.98 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473089  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1314  phosphonate metabolism  57.97 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2692  phosphonate metabolism  62.37 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4436  phosphonate metabolism  61.66 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4122  phosphonate metabolism  61.5 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4209  phosphonate metabolism  63.27 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3701  phosphonate metabolism  61.02 
 
 		 367 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.502846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0889  phosphonate metabolism  61.83 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0519  phosphonate metabolism  61.29 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0270  hypothetical protein  61.27 
 
 		 368 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3330  phosphonate metabolism protein  61.5 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4653  phosphonate metabolism protein PhnI  60.48 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4340  phosphonate metabolism protein PhnI  60.22 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3927  phosphonate metabolism  60.48 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4188  phosphonate metabolism  63.13 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4565  phosphonate metabolism protein PhnI  60.22 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3892  phosphonate metabolism  60.48 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5612  phosphonate metabolism protein PhnI  60.22 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03931  hypothetical protein  60.48 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4780  phosphonate metabolism  60.32 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0445893  normal  0.380698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1284  phosphonate metabolism  60.86 
 
 		 367 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03971  carbon-phosphorus lyase complex subunit  60.48 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3562  phosphonate metabolism protein PhnI  59.15 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0764  phosphonate metabolism protein  59.09 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2194  phosphonate metabolism  58.24 
 
 		 369 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4233  phosphonate metabolism  59.52 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.512467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0760  phosphonate metabolism  61.23 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4029  PhnI protein  58.89 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3696  phosphonate metabolism  58.89 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0577  phosphonate metabolism  56.61 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0303  phosphonate metabolism  59.14 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2913  phosphonate metabolism  59.68 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0481  phosphonate metabolism  56.35 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1310  phosphonate metabolism  60.5 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0426628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1927  phosphonate metabolism  52.04 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.819731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2280  phosphonate metabolism protein PhnI  52.04 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1003  phosphonate metabolism  41.71 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0974  phosphonate metabolism  41.71 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4039  phosphonate metabolism  41.84 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.226213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0219  phosphonate metabolism  41.84 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.73751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3510  phosphonate metabolism  43.67 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4999  phosphonate metabolism  40.86 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00419491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3690  phosphonate metabolism  39.9 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2084  phosphonate metabolism  38.97 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0230  phosphonate metabolism  41.45 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.677261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2294  phosphonate metabolism protein  40.99 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4147  phosphonate metabolism  42.43 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2291  phosphonate metabolism  42.63 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0426  phosphonate metabolism protein  41.9 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0462  phosphonate metabolism protein  41.9 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.059073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1589  phosphonate metabolism  42.82 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5871  phosphonate metabolism protein PhnI  29.44 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>