76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5871 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5871  phosphonate metabolism protein PhnI  100 
 
 
342 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2280  phosphonate metabolism protein PhnI  29.49 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1927  phosphonate metabolism  29.49 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.819731  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3701  phosphonate metabolism  29.33 
 
 
367 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.502846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3855  phosphonate metabolism  32.02 
 
 
368 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5612  phosphonate metabolism protein PhnI  34.73 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4565  phosphonate metabolism protein PhnI  35.01 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3330  phosphonate metabolism protein  31.28 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3892  phosphonate metabolism  34.73 
 
 
354 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03931  hypothetical protein  34.73 
 
 
354 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3927  phosphonate metabolism  34.73 
 
 
354 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2922  phosphonate metabolism  30.88 
 
 
370 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.412062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03971  carbon-phosphorus lyase complex subunit  34.73 
 
 
354 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4653  phosphonate metabolism protein PhnI  34.73 
 
 
354 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0889  phosphonate metabolism  30.7 
 
 
358 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0519  phosphonate metabolism  31.65 
 
 
361 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0303  phosphonate metabolism  32.77 
 
 
354 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4340  phosphonate metabolism protein PhnI  34.45 
 
 
354 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2959  phosphonate metabolism  30.29 
 
 
368 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131186  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0143  phosphonate metabolism  30.85 
 
 
394 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0020256  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6096  phosphonate metabolism  31.07 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2692  phosphonate metabolism  31.27 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4147  phosphonate metabolism  31.71 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2294  phosphonate metabolism protein  31.9 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3775  phosphonate metabolism protein  29.75 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3690  phosphonate metabolism  30 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0815  phosphonate metabolism  28.38 
 
 
371 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4436  phosphonate metabolism  29.81 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4122  phosphonate metabolism  29.71 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830833  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0270  hypothetical protein  31.19 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2561  phosphonate metabolism protein PhnI  29.2 
 
 
359 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2291  phosphonate metabolism  31.4 
 
 
374 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3696  phosphonate metabolism  30.39 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3562  phosphonate metabolism protein PhnI  30.39 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4999  phosphonate metabolism  27.83 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00419491  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0760  phosphonate metabolism  29.58 
 
 
365 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0974  phosphonate metabolism  27.66 
 
 
361 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1003  phosphonate metabolism  27.66 
 
 
361 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4029  PhnI protein  30.11 
 
 
392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1284  phosphonate metabolism  30.11 
 
 
367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2181  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  30 
 
 
390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0396272  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2912  phosphonate metabolism  31.37 
 
 
370 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1751  hypothetical protein  29.67 
 
 
366 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5942  phosphonate metabolism  30.25 
 
 
381 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4188  phosphonate metabolism  29.26 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3510  phosphonate metabolism  31.65 
 
 
390 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2253  phosphonate metabolism  29.75 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495936  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0219  phosphonate metabolism  29.82 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.73751  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4039  phosphonate metabolism  29.82 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.226213  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4780  phosphonate metabolism  29.38 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0445893  normal  0.380698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4233  phosphonate metabolism  29.05 
 
 
368 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.512467  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20380  hypothetical protein  28.93 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140079  normal  0.853363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2194  phosphonate metabolism  28.05 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2913  phosphonate metabolism  31.3 
 
 
360 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0462  phosphonate metabolism protein  31.85 
 
 
380 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.059073  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0426  phosphonate metabolism protein  31.85 
 
 
380 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0481  phosphonate metabolism  29.17 
 
 
367 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2084  phosphonate metabolism  27.1 
 
 
378 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1310  phosphonate metabolism  30 
 
 
360 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0426628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3827  phosphonate metabolism  29.53 
 
 
368 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5846  putative PhnI protein, phosphonate metabolism  30.25 
 
 
367 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473089  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0577  phosphonate metabolism  28.13 
 
 
367 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2884  phosphonate metabolism  28.91 
 
 
358 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4209  phosphonate metabolism  31.01 
 
 
360 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4091  phosphonate metabolism  30.45 
 
 
368 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658015  normal  0.0458753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1589  phosphonate metabolism  29.24 
 
 
389 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0764  phosphonate metabolism protein  27.27 
 
 
373 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0230  phosphonate metabolism  30.83 
 
 
460 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.677261  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3343  phosphonate metabolism protein PhnI  30.08 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2588  phosphonate metabolism protein PhnI  29.44 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.977228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1179  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  29.44 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0318  phosphonate metabolism protein PhnI  29.44 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3354  phosphonate metabolism protein (PhnI)  29.41 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2402  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  29.44 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1314  phosphonate metabolism  27.01 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625043  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3309  phosphonate metabolism protein PhnI  29.14 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>