76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4147 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4147  phosphonate metabolism  100 
 
 
374 aa  758    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2291  phosphonate metabolism  97.59 
 
 
374 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3690  phosphonate metabolism  70.05 
 
 
374 aa  549  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4039  phosphonate metabolism  74.25 
 
 
379 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.226213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0219  phosphonate metabolism  74.25 
 
 
379 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.73751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2084  phosphonate metabolism  69.5 
 
 
378 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2294  phosphonate metabolism protein  74.79 
 
 
370 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1003  phosphonate metabolism  66.48 
 
 
361 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4999  phosphonate metabolism  68.42 
 
 
364 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00419491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0974  phosphonate metabolism  66.48 
 
 
361 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0462  phosphonate metabolism protein  66.58 
 
 
380 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.059073  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0426  phosphonate metabolism protein  66.58 
 
 
380 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3510  phosphonate metabolism  48.65 
 
 
390 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1589  phosphonate metabolism  47.95 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0519  phosphonate metabolism  46.56 
 
 
361 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2692  phosphonate metabolism  45.68 
 
 
363 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0889  phosphonate metabolism  44.72 
 
 
358 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2181  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  42.25 
 
 
390 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0396272  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3696  phosphonate metabolism  44.44 
 
 
392 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3562  phosphonate metabolism protein PhnI  45.38 
 
 
386 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0270  hypothetical protein  43.78 
 
 
368 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4029  PhnI protein  44.17 
 
 
392 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3892  phosphonate metabolism  45.33 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3701  phosphonate metabolism  43.42 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.502846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5942  phosphonate metabolism  42.25 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03931  hypothetical protein  45.16 
 
 
354 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03971  carbon-phosphorus lyase complex subunit  45.16 
 
 
354 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4340  phosphonate metabolism protein PhnI  44.59 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3927  phosphonate metabolism  44.59 
 
 
354 aa  272  9e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1310  phosphonate metabolism  46.13 
 
 
360 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0426628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2561  phosphonate metabolism protein PhnI  44.2 
 
 
359 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4653  phosphonate metabolism protein PhnI  44.89 
 
 
354 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1751  hypothetical protein  44.32 
 
 
366 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2922  phosphonate metabolism  42.82 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.412062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0303  phosphonate metabolism  44.51 
 
 
354 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4565  phosphonate metabolism protein PhnI  44.32 
 
 
354 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5612  phosphonate metabolism protein PhnI  44.57 
 
 
354 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2253  phosphonate metabolism  43.8 
 
 
359 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495936  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2959  phosphonate metabolism  44.04 
 
 
368 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131186  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3775  phosphonate metabolism protein  40.48 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2913  phosphonate metabolism  44.72 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3343  phosphonate metabolism protein PhnI  43.51 
 
 
402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20380  hypothetical protein  43.5 
 
 
366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140079  normal  0.853363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3354  phosphonate metabolism protein (PhnI)  43.78 
 
 
404 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0143  phosphonate metabolism  42.43 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0020256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2402  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  43.16 
 
 
405 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0318  phosphonate metabolism protein PhnI  43.16 
 
 
405 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2588  phosphonate metabolism protein PhnI  43.16 
 
 
407 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.977228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3309  phosphonate metabolism protein PhnI  43.43 
 
 
400 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1179  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  43.16 
 
 
407 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0815  phosphonate metabolism  42.59 
 
 
371 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0760  phosphonate metabolism  44.6 
 
 
365 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0577  phosphonate metabolism  42.9 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3855  phosphonate metabolism  42.11 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2884  phosphonate metabolism  42.39 
 
 
358 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124604  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2194  phosphonate metabolism  41.55 
 
 
369 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4780  phosphonate metabolism  41.08 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0445893  normal  0.380698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6096  phosphonate metabolism  43.02 
 
 
364 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0481  phosphonate metabolism  42.66 
 
 
367 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1284  phosphonate metabolism  43.96 
 
 
367 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3330  phosphonate metabolism protein  42.86 
 
 
394 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2912  phosphonate metabolism  43.06 
 
 
370 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1927  phosphonate metabolism  41.99 
 
 
365 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.819731  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2280  phosphonate metabolism protein PhnI  41.99 
 
 
365 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3827  phosphonate metabolism  43.09 
 
 
368 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4436  phosphonate metabolism  42.66 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5846  putative PhnI protein, phosphonate metabolism  43.19 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473089  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4122  phosphonate metabolism  41.48 
 
 
368 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830833  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0230  phosphonate metabolism  38.7 
 
 
460 aa  250  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.677261  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4091  phosphonate metabolism  43.21 
 
 
368 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658015  normal  0.0458753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4233  phosphonate metabolism  41.83 
 
 
368 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.512467  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4188  phosphonate metabolism  44.09 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4209  phosphonate metabolism  42.42 
 
 
360 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0764  phosphonate metabolism protein  42.78 
 
 
373 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1314  phosphonate metabolism  42.13 
 
 
426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5871  phosphonate metabolism protein PhnI  29.94 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>