76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3690 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3690  phosphonate metabolism  100 
 
 		 374 aa  773    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2084  phosphonate metabolism  87.57 
 
 		 378 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1003  phosphonate metabolism  71.15 
 
 		 361 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0974  phosphonate metabolism  71.15 
 
 		 361 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2294  phosphonate metabolism protein  72.13 
 
 		 370 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4147  phosphonate metabolism  70.05 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2291  phosphonate metabolism  70.32 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0219  phosphonate metabolism  70.51 
 
 		 379 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.73751  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4039  phosphonate metabolism  70.51 
 
 		 379 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.226213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4999  phosphonate metabolism  68.87 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00419491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0462  phosphonate metabolism protein  66.3 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.059073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0426  phosphonate metabolism protein  66.3 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3510  phosphonate metabolism  47.97 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1589  phosphonate metabolism  47.27 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0889  phosphonate metabolism  42.23 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3562  phosphonate metabolism protein PhnI  44.11 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3696  phosphonate metabolism  44.11 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0519  phosphonate metabolism  44.41 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4029  PhnI protein  43.84 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5942  phosphonate metabolism  40.77 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2692  phosphonate metabolism  43.18 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0815  phosphonate metabolism  41.83 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1751  hypothetical protein  43.58 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0270  hypothetical protein  40.97 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2959  phosphonate metabolism  42.08 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3775  phosphonate metabolism protein  39.29 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0230  phosphonate metabolism  38.94 
 
 		 460 aa  265  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.677261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2561  phosphonate metabolism protein PhnI  43.18 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0577  phosphonate metabolism  41.92 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20380  hypothetical protein  42.54 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140079  normal  0.853363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0143  phosphonate metabolism  39.9 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0020256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2913  phosphonate metabolism  42.78 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1310  phosphonate metabolism  42.74 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0426628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3309  phosphonate metabolism protein PhnI  41.73 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3855  phosphonate metabolism  41.82 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6096  phosphonate metabolism  41.53 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.546807  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2181  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  38.42 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0396272  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2922  phosphonate metabolism  40.83 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.412062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3343  phosphonate metabolism protein PhnI  41.46 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3354  phosphonate metabolism protein (PhnI)  41.46 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2194  phosphonate metabolism  40.16 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2253  phosphonate metabolism  42.23 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1179  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  40.86 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2402  alkylphosphonate utilization operon protein PhnI  40.86 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3892  phosphonate metabolism  42.19 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2884  phosphonate metabolism  41.23 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0318  phosphonate metabolism protein PhnI  40.86 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2588  phosphonate metabolism protein PhnI  40.86 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.977228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4653  phosphonate metabolism protein PhnI  41.92 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3701  phosphonate metabolism  43.53 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.502846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5612  phosphonate metabolism protein PhnI  41.92 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4340  phosphonate metabolism protein PhnI  41.92 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3927  phosphonate metabolism  41.92 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03931  hypothetical protein  41.92 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03971  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.92 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4565  phosphonate metabolism protein PhnI  41.92 
 
 		 354 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4233  phosphonate metabolism  39.3 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.512467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1284  phosphonate metabolism  40.76 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0760  phosphonate metabolism  41.34 
 
 		 365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2912  phosphonate metabolism  41.67 
 
 		 370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3330  phosphonate metabolism protein  41.67 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1927  phosphonate metabolism  39.84 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.819731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2280  phosphonate metabolism protein PhnI  39.84 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0481  phosphonate metabolism  40.55 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4436  phosphonate metabolism  38.77 
 
 		 368 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0303  phosphonate metabolism  41.53 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5846  putative PhnI protein, phosphonate metabolism  40.11 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473089  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4122  phosphonate metabolism  38.59 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4780  phosphonate metabolism  40.77 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0445893  normal  0.380698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4209  phosphonate metabolism  41.06 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3827  phosphonate metabolism  39.52 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4091  phosphonate metabolism  38.98 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658015  normal  0.0458753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4188  phosphonate metabolism  40.81 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0764  phosphonate metabolism protein  38.98 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1314  phosphonate metabolism  35.36 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.625043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5871  phosphonate metabolism protein PhnI  28.48 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>