35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3042 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3042  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3199  hypothetical protein  72.5 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3144  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2796  hypothetical protein  47.37 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  41.77 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  41.03 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  39.24 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  34.62 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  36.71 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  36.71 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  29.87 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  30.86 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  31.58 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2899  hypothetical protein  48.68 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>