33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3144 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3144  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2796  hypothetical protein  93.75 
 
 		 80 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2899  hypothetical protein  72.15 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  38.75 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  33.75 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3042  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3199  hypothetical protein  45.07 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  32.5 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  38.75 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  34.62 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  38.75 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  33.75 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0439  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3519  hypothetical protein  36.14 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23711  normal  0.113167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  35.14 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  36.62 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0485  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0513  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0286609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2591  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3600  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>