13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4427 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4324  hypothetical protein  81.77 
 
 		 620 aa  907    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.534524  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4427  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1217    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0021  WD40 domain protein beta Propeller  38.86 
 
 		 684 aa  250  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4038  hypothetical protein  31.83 
 
 		 596 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  26.99 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.11 
 
 		 419 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  61.11 
 
 		 1159 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  53.85 
 
 		 521 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.44 
 
 		 656 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.97 
 
 		 440 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  28.97 
 
 		 441 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.06 
 
 		 695 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>