24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2232 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2232  putative transmembrane protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2044  putative transmembrane protein  75.34 
 
 		 144 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2437  putative transmembrane protein  73.61 
 
 		 142 aa  203  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0871  putative transmembrane protein  54.26 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.526733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2626  hypothetical protein  52.88 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4413  hypothetical protein  46.59 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6794  hypothetical protein  43.18 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000343799  hitchhiker  0.000000433024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2839  hypothetical protein  43.18 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3236  hypothetical protein  39.22 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3765  hypothetical protein  39.22 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0736027  decreased coverage  0.000540931 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0601  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4877  hypothetical protein  40.45 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271941  hitchhiker  0.00136694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2555  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0339  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.390499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2418  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1683  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1487  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0858  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0346851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0308  hypothetical protein  40.45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3659  hypothetical protein  39.22 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3868  hypothetical protein  39.22 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2228  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.330155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1712  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.269787  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1430  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.827032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>