24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3659 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3659  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411329  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3868  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0113613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2228  hypothetical protein  95.42 
 
 
131 aa  233  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.330155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3765  hypothetical protein  88.15 
 
 
135 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0736027  decreased coverage  0.000540931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3236  hypothetical protein  88.15 
 
 
135 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4877  hypothetical protein  90.84 
 
 
131 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271941  hitchhiker  0.00136694 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0308  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0339  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.390499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2418  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2555  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1683  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1487  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0858  hypothetical protein  86.81 
 
 
132 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0346851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0601  hypothetical protein  84.62 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4413  hypothetical protein  61.48 
 
 
134 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6794  hypothetical protein  60.61 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000343799  hitchhiker  0.000000433024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2839  hypothetical protein  59.85 
 
 
131 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2626  hypothetical protein  40.19 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0871  putative transmembrane protein  50 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.526733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2232  putative transmembrane protein  38.24 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2044  putative transmembrane protein  37.08 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2437  putative transmembrane protein  37.08 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259708  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1712  putative transmembrane protein  32.43 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.269787  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1430  putative transmembrane protein  36.36 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>