24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4413 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4413  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  270  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6794  hypothetical protein  71.64 
 
 
131 aa  183  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000343799  hitchhiker  0.000000433024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2839  hypothetical protein  72.39 
 
 
131 aa  182  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3765  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0736027  decreased coverage  0.000540931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3236  hypothetical protein  60.74 
 
 
135 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2228  hypothetical protein  61.48 
 
 
131 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.330155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3659  hypothetical protein  69.23 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411329  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3868  hypothetical protein  69.23 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0113613  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0308  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0339  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.390499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2418  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2555  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1683  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1487  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0858  hypothetical protein  71.43 
 
 
132 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0346851  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4877  hypothetical protein  71.43 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271941  hitchhiker  0.00136694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0601  hypothetical protein  70.33 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2626  hypothetical protein  44.04 
 
 
139 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0871  putative transmembrane protein  45.98 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.526733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2232  putative transmembrane protein  46.53 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2044  putative transmembrane protein  42.7 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2437  putative transmembrane protein  42.7 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259708  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1430  putative transmembrane protein  38.2 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1712  putative transmembrane protein  28.7 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.269787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>