11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1812 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1812  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  286  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0156  hypothetical protein  50.79 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3030  hypothetical protein  50.81 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2438  hypothetical protein  44.19 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1438  hypothetical protein  40.85 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4114  hypothetical protein  29.23 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3817  hypothetical protein  26.83 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7398  hypothetical protein  29.23 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.250308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0158  hypothetical protein  29.77 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>