13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0156 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0156  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  273  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3030  hypothetical protein  71.2 
 
 
132 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1812  hypothetical protein  50.79 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203757  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2438  hypothetical protein  44.53 
 
 
144 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1438  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6852  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4657  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423181  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3706  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334418  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3815  hypothetical protein  35.16 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.178878  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3845  hypothetical protein  70.83 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0158  hypothetical protein  31.91 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  36 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  28.81 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>