14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3030 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0156  hypothetical protein  71.2 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1812  hypothetical protein  50.81 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2438  hypothetical protein  36.51 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1438  hypothetical protein  38.02 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3845  hypothetical protein  84 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  35.9 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4657  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423181  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3706  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334418  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3815  hypothetical protein  37.23 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.178878  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3817  hypothetical protein  29.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5028  hypothetical protein  35.56 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.795956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  27.97 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2248  hypothetical protein  30.38 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>