17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3706 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4657  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423181  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3706  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334418  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3815  hypothetical protein  99.28 
 
 
139 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.178878  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  87.77 
 
 
139 aa  245  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5028  hypothetical protein  76.52 
 
 
142 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.795956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3817  hypothetical protein  40.94 
 
 
135 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4114  hypothetical protein  38.35 
 
 
136 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7398  hypothetical protein  38.17 
 
 
136 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.250308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0158  hypothetical protein  33.59 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4422  hypothetical protein  36.72 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6852  hypothetical protein  29.03 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3030  hypothetical protein  37.14 
 
 
132 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.921397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16290  hypothetical protein  29.69 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0156  hypothetical protein  35.58 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1401  hypothetical protein  28.12 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2248  hypothetical protein  33.71 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>