17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4114 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4114  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7398  hypothetical protein  97.79 
 
 
136 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.250308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3817  hypothetical protein  55.91 
 
 
135 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  39.53 
 
 
139 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3815  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.178878  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4657  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423181  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3706  hypothetical protein  37.29 
 
 
139 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334418  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0158  hypothetical protein  40.77 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5028  hypothetical protein  39.66 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.795956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4422  hypothetical protein  32.73 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2248  hypothetical protein  30.84 
 
 
239 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6852  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1812  hypothetical protein  29.23 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203757  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16290  hypothetical protein  28.36 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2438  hypothetical protein  29.71 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5065  hypothetical protein  31.09 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.39252  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  24.03 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>