14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0158 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0158  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  340  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4422  hypothetical protein  38.97 
 
 
153 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3817  hypothetical protein  38.4 
 
 
135 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7398  hypothetical protein  40.77 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.250308  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4114  hypothetical protein  40.77 
 
 
136 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5028  hypothetical protein  36.97 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.795956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2403  hypothetical protein  33.86 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4657  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423181  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3706  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334418  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3815  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.178878  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1163  hypothetical protein  30.47 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141676  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6852  hypothetical protein  32.94 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1812  hypothetical protein  29.77 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0156  hypothetical protein  31.91 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>