20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03693 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  824    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  51.02 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  47.78 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  48.27 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  46.25 
 
 		 427 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  43.77 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  38.96 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  38.77 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  42.14 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  29.25 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  33.94 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  31.92 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  31.16 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  31.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1179  hypothetical protein  25.07 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  23.48 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0381  hypothetical protein  26.41 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1073  hypothetical protein  31.07 
 
 		 435 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  29.23 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>