15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5098 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  901    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  47.53 
 
 
402 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  30.92 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  33.53 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  32.17 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  30.56 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  30.27 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  29.81 
 
 
427 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  32.3 
 
 
427 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  24.23 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  30.6 
 
 
416 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  29.43 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  29.37 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  31.65 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  28 
 
 
412 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>