20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3976 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  56.09 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  56.5 
 
 		 422 aa  352  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  52.77 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  48.08 
 
 		 416 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  46.93 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  40.4 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  39.9 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  39.84 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  30.75 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  36.13 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  29.84 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  29.91 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  27.11 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  30.12 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  30.54 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  24.12 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1179  hypothetical protein  24.52 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2247  hypothetical protein  20.17 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0381  hypothetical protein  23.81 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>