21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3862 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  49.61 
 
 
405 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  49.87 
 
 
405 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  41.73 
 
 
398 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  39.45 
 
 
427 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  38.37 
 
 
416 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  39.48 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  38.46 
 
 
412 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  40.74 
 
 
427 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  35.42 
 
 
466 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  30.5 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  29.7 
 
 
465 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  32.33 
 
 
480 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  33.11 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  33.43 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  27.5 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1179  hypothetical protein  26.17 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  31.53 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0381  hypothetical protein  27.65 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2034  hypothetical protein  20.97 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1073  hypothetical protein  33.55 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>