15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5501 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  921    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  56.18 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  36.62 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  31.15 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  32.88 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  31.14 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  32.42 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  28.43 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  27.51 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  30.74 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  30.89 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  27.11 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  30.04 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  26.17 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>