18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0488 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  842    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1492  hypothetical protein  56.12 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1083  hypothetical protein  59.04 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000423957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3976  hypothetical protein  52.48 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.667235  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_003296  RS03693  hypothetical protein  46.73 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0539  hypothetical protein  46.83 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2870  hypothetical protein  40.98 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3862  hypothetical protein  39.42 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2801  hypothetical protein  40.33 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0169  hypothetical protein  36.51 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0630  hypothetical protein  30.32 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2670  hypothetical protein  29.31 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2613  hypothetical protein  30.9 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0259384  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0870  hypothetical protein  31.56 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5098  hypothetical protein  31.67 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0121004  normal  0.708615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5501  hypothetical protein  29.28 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000679714  hitchhiker  0.00404063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0381  hypothetical protein  25.44 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0301  hypothetical protein  21.1 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>