More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03159 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03159  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
599 aa  1226    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.954518  normal  0.246981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  35.58 
 
 
494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.31 
 
 
382 aa  110  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  32.17 
 
 
305 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  29.45 
 
 
1585 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.66 
 
 
1030 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  29.52 
 
 
762 aa  104  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  35.81 
 
 
426 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.27 
 
 
1156 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  35.58 
 
 
442 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.84 
 
 
2413 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.07 
 
 
490 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  30.26 
 
 
931 aa  99.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.35 
 
 
2171 aa  98.2  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  40.98 
 
 
344 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.83 
 
 
427 aa  98.2  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  39.77 
 
 
219 aa  97.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  32.29 
 
 
541 aa  93.6  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  31.17 
 
 
329 aa  92  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  32.34 
 
 
756 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.52 
 
 
1402 aa  87.4  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  26.44 
 
 
891 aa  87  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  30.04 
 
 
865 aa  87  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  27.09 
 
 
723 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.14 
 
 
321 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  32.75 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  31.69 
 
 
1061 aa  84  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  28.52 
 
 
337 aa  84  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  28.28 
 
 
4520 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2058  hypothetical protein  30.41 
 
 
951 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.45 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  32.11 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  32.01 
 
 
395 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  35.91 
 
 
1097 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  29.44 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  32.9 
 
 
811 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  34.21 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  34.78 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  26.77 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  30.36 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  33.7 
 
 
216 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  29.65 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  31.22 
 
 
870 aa  78.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  28.73 
 
 
790 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  29.62 
 
 
855 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  30.55 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  32.57 
 
 
1116 aa  77.4  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  29.07 
 
 
646 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  25.44 
 
 
1005 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  31.7 
 
 
368 aa  77  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.74 
 
 
545 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.28 
 
 
954 aa  76.3  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  28.8 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  31.15 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
1622 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  26.46 
 
 
715 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 
766 aa  74.3  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  27.46 
 
 
740 aa  73.9  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  25.35 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  28.82 
 
 
1249 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  27.84 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  29.95 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  28 
 
 
821 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 
1387 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2066  Ankyrin  32.49 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000116575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.02 
 
 
293 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
1021 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  33.53 
 
 
237 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81069  positive regulatory protein of phosphate pathway  25.74 
 
 
1302 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  34.88 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  26.02 
 
 
253 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  33.33 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  30.07 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  25.88 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  29.31 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  31.48 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 
1198 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  28.25 
 
 
933 aa  68.2  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  31.07 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  31.88 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  29.37 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  30.99 
 
 
711 aa  67.4  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  27.67 
 
 
2122 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1154  ankyrin repeat-containing protein  28.86 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  31.28 
 
 
1099 aa  67.4  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  30.07 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  30.28 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  30.07 
 
 
255 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  35.48 
 
 
135 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 
1133 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  30.07 
 
 
255 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  25.85 
 
 
640 aa  66.6  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  30.59 
 
 
287 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  26.97 
 
 
335 aa  65.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  30.58 
 
 
1101 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  32.6 
 
 
264 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  35.07 
 
 
257 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  28.67 
 
 
290 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  29.1 
 
 
369 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  33.77 
 
 
157 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>